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viernes, 21 de noviembre de 2008

BOINC ¿y luego?

Como muchos aún os preguntáis de qué va esto del BOINC y la computación distribuida, vamos a intentar aclarar un poquito más las cosas.

Cómo Funciona la Computación Distribuida

Computación Distribuida: Informaciones Básicas.
La computación distribuida une miles de computadores individuales, creando un gran sistema con poder de computación masivo superando ampliamente el poder de un puñado de súper computadores.
Como el trabajo se divide en pequeñas partes que se pueden procesar simultáneamente, el tiempo de investigación se reduce de años a meses.
La tecnología también es más eficaz en lo que se refiere al costo, permitiendo un mejor uso de fondos fundamentales.


Cambiar Nuestro Mundo Ahora.
La computación distribuida no es una tecnología del futuro. World Community Grid está trabajando actualmente, aplicando esta tecnología en proyectos de investigación emocionantes en beneficio de todos.
Nuestro primer proyecto, el Plegado del proteoma humano, está identificando proteínas producidas por los genes humanos.
Con esta información, los científicos pueden entender cómo algunos defectos de las proteínas pueden ocasionar enfermedades, facilitando el descubrimiento de la cura.
En 2003, con la computación distribuida, en menos de tres meses, los científicos identificaron 44 tratamientos posibles para luchar contra la mortal viruela. Sin esta red, el trabajo hubiera durado más de un año.

Bueno, una vez aclarado un poco el concepto, hemos instalado el programa BOINC, nos hemos añadido al/os proyectos que nos interesan ¿y luego?.

Lo mejor es procesar en varios proyectos a la vez, así, si uno de ellos se queda sin unidades de trabajo o no nos las manda porque se ha caído el servidor, podremos seguir procesando unidades de los otros proyectos.
¿Pero qué proyectos me instalo?
Lo mejor es tener siempre uno de los proyectos grandes, para mí, de los mejores es el World Community Grid, que engloba los siguientes proyectos actualmente:

Nutritious Rice for the World - Arroz Nutritivo para el Mundo -
El hambre y la desnutrición son los principales riesgos de la salud mundial. Casi el 30% de la población mundial sufre de alguna forma de desnutrición.
Cada año, 10 millones de personas mueren de hambre y enfermedades asociadas al hambre. De hecho, más personas mueren de hambre y desnutrición anualmente que de SIDA, malaria y tuberculosis juntas.
El arroz es el principal alimento de más de la mitad de la población mundial. El 20% del total de energía generada por la ingestión de alimentos por cada hombre, mujer y niño en el mundo viene del arroz. Sólo en Asia, más de 2 billones de personas obtienen hasta un 70% de su energía dietética diaria del arroz y de sus derivados.
Mejorando las variedades de arroz para producir cosechas más grandes, más resistentes y optimizadas desde el punto de vista nutricional, se afectarán positivamente las vidas de billones de personas.

Help Conquer Cancer - Ayuda a Derrotar el Cáncer
Para tener un impacto significativo en la comprensión del cáncer y de su tratamiento, deben ser descubiertos nuevos métodos terapéuticos capaces de enfocar el cáncer metastásico (extendido a otras partes del cuerpo) e identificados los marcadores diagnóstico (o indicadores de la enfermedad), que pueden detectar la enfermedad en fase inicial.
Los investigadores han sido capaces de hacer importantes descubrimientos cuando estudian múltiples cánceres humanos, incluso cuando tienen información limitada sobre las proteínas involucradas. Sin embargo, para comprender mejor y poder tratar el cáncer, es importante para los científicos el descubrimiento de nuevas proteínas involucradas en el cáncer y su estructura y función.
Los científicos están especialmente interesados en las proteínas que pueden tener una relación funcional con el cáncer: proteínas sobre expresadas o reprimidas en cánceres, o proteínas que han sufrido modificaciones o mutaciones produciendo cambios en su estructura.
La mejora de la cristalografía por rayos X permitirá a los investigadores determinar con mayor rapidez la estructura de numerosas proteínas asociadas al cáncer. Esto permitirá comprender mejor la función de estas proteínas y encontrar posibles intervenciones farmacéuticas para tratar esta enfermedad fatal.

Discovering Dengue Drugs Together - Descubriendo Fármacos contra el Denhue Juntos
Este proyecto descubrirá pistas de fármacos prometedores para combatir la reproducción del virus en la familia Flaviviridae. Miembros de esta familia, incluso virus del dengue, hepatitis C, Nilo occidental y fiebre amarilla, presentan importantes amenazas a la salud en los países desarrollados y en los países en vía de desarrollo.
Más de 40% de la población mundial corre el riesgo de infección por el virus del dengue. Anualmente, 1,5 millón de personas reciben tratamiento para dengue y fiebre hemorrágica del dengue. El virus de la hepatitis C ha infectado casi 2% de la población mundial. El virus de la fiebre amarilla y del Nilo occidental también tuvo un impacto mundial significativo. Desafortunadamente, no hay fármacos que traten estas enfermedades con efectividad. Consecuentemente, la atención de apoyo necesaria para tratar estas infecciones y minimizar la mortalidad duramente pone a prueba centros de salud ya sobrecargados en todo el mundo.
Se espera el descubrimiento de fármacos antivirales específicos y de amplio–espectro, para mejorar significativamente la salud mundial.

Human Proteome Folding Fase 2 - Plegado del Proteoma Humano Fase 2
El Plegado del proteoma humano – Fase 2 (HPF2) continúa desde donde se interrumpió la primera fase. Los dos objetivos principales del proyecto son: 1) obtener estructuras con mayor resolución para proteínas humanas específicas y proteínas de agentes patógenos y 2) explorar más ampliamente los límites de la predicción de estructuras de proteínas mejorando el desarrollo de la predicción de estructura del software Rosetta. En consecuencia, el proyecto tratará de dos imperativos paralelos muy importantes, uno biológico y uno biofísico.

FightAIDS @Home - Lucha contra el SIDA desde Casa
Para enfrentar estos desafíos, el proyecto FightAIDS@Home (lucha contra el SIDA desde casa) del World Community Grid utiliza un programa de software denominado AutoDock desarrollado en el laboratorio del Prof. Olson. AutoDock es un conjunto de herramientas que predice cómo pequeñas moléculas, como las de los posibles medicamentos, pueden enlazarse o "anclar" en un receptor de estructura 3D conocida.
La primera versión del AutoDock fue creada en el Laboratorio Olson en 1990 por el Dr. David S. Goodsell, desde entonces, versiones más nuevas, desarrolladas por Dr. Garrett M. Morris, han sido lanzadas, lo que añade nueva comprensión científica y estrategias al AutoDock, dejándolo más robusto en términos computacionales, más rápido y más fácil para que otros científicos lo usen. Desde el comienzo de este proyecto, el World Community Grid ha ejecutado una versión pre-release de AutoDock4.
En agosto de 2007, el World Community Grid comenzó a ejecutar la versión 4 de AutoDock públicamente nueva, que es más rápida, mas exacta, que puede manejar moléculas objetivo flexibles y, por esto, también pueden usárselas para análisis de acoplamientos de proteína a proteína.
Se usa AutoDock en el proyecto FightAIDS@Home en el World Community Grid para reducir grandes números de diferentes moléculas pequeñas para la proteasa de HIV, para que se puedan encontrar las mejores moléculas por medio de la computación, seleccionarlas y probarlas en el laboratorio en cuanto a eficacia en comparación al virus HIV. Uniendo sus fuerzas, el The Scripps Research Institute, el World Community Grid y su creciente cuerpo de voluntarios pueden encontrar mejores tratamientos mucho más rápido que nunca.

Además del WCG, existen otros proyectos como ClimatePrediction.Net, SETI, Rosetta, que prácticamente nunca se quedan sin unidades para poder procesar, los ideal sería instalar el proyecto que más os guste y además añadir alguno de los arriba mencionados.

Un saludo

Millonarios en GPUGRID

Pues ya hemos conseguido superar la barrera de los 2.000.000 de puntos en el proyecto GPUGRID, todo un logro.

Nos hemos situado en la primera posición a nivel nacional con diferencia con el segundo equipo grib/upf (los que han hecho posible el utilizar los procesadores cell en PS3GRID).

Hay que recordar que sólo hace 15 meses que empecemos a crunchear en el proyecto, aunque el impulso se lo hemos dado al principio de éste verano, cuando se han empezado a unir al equipo miembros con gráficas suficientes para poder procesar las unidades del proyecto (os recuerdo que sólo funciona en gráficas Nvidia módelos 8XXX y con el chip G92b o superior).

Un saludo

jueves, 20 de noviembre de 2008

Usuario del día en APS

Seguimos estando de enhorabuena.

Hoy le ha tocado ser usuario del día a yattote en APS

El muy bribón ya lleva dos en lo que va de semana.

Un saludo

¿Una internet en el espacio?

Según un artículo publicado hoy en el periódico gratuito ADN, la NASA, demuestra que es posible crear una internet en el espacio.

Para ello, han creado el protocolo DTN (Deep Space Network), que es capaz de mantener estable un flujo de datos pese al retardo de las comunicaciones y las pérdidas de señal.


Así mismo, la NASA comunicó que en el pasado octubre, sus ingenieros utilizaron un software especial para transmitir docenas de imágenes hacia y desde una nave a más de 32 millones de kilómetros de la Tierra.

Por lo que se ve, ya se han resuelto los problemas de pérdidas de señal y de distancia, ya que recordemos que en el espacio además de la pérdida de señal por estar obstaculizados por los planetas, podemos sufrir alteraciones en la señal por culpa de las tormentas solares.

Fuente:

ADN


Un saludo

miércoles, 19 de noviembre de 2008

El Acelerador de Partículas (LHC) se retrasa de nuevo


Parece que se confirman los rumores sobre un nuevo retraso en la puesta en servicio (por segunda vez) del acelerador de partículas (LHC), la nueva fecha previsible apunta ahora para el verano del año que viene (2009).

Os dejo parte de la información publicada.

El portavoz del CERN, James Gillies, ha confirmado los rumores que habían aparecido en la prensa alemana de Suiza, que aseguraban que la fecha apuntada de la próxima primavera para volver a poner en funcionamiento la llamada 'máquina del Big Bang', no es realista. "Será en verano, más que en primavera", afirmó el portavoz, quien dijo que el 12 de diciembre el consejo del CERN hará una evaluación de la situación.

El proyecto estrella del CERN se puso en funcionamiento por primera vez el 10 de septiembre, cuando los científicos del laboratorio lograron que el primer haz de protones circulara y diera una vuelta completa por el gigantesco túnel de 27 kilómetros de circunferencia que constituye el acelerador, situado bajo la frontera suizo-francesa, a las afueras de Ginebra.
Sólo 10 días después, una avería en uno de los ocho sectores que conforman el acelerador obligó a parar el experimento.
El problema se debió a una importante fuga de helio en el sector 3-4 del túnel, y poco después se confirmó que se debió a una conexión eléctrica defectuosa entre dos imanes del acelerador.

A pesar de la avería, el CERN celebró una inauguración oficial del acelerador el pasado 21 de octubre, aunque deslucida por la ausencia de grandes personalidades.

Diversas informaciones aparecidas en la prensa suiza culpan ahora en parte de la avería a las "prisas" del director general del CERN, Robert Aymar, quien habría querido arrancar el acelerador a toda costa antes de que finalice su mandato este año, sin que se hubieran hecho todas las pruebas necesarias.

Un saludo

Fuentes:

Mr. Boinc
El Mundo

Usuario del día en Pirates

Vaya vaya, tenemos un nuevo pirata surcando los mares de la computación distribuida y el boinc, y es nuestro amigo werwolf, que hoy le ha tocado ser usuario del día en Pirates.

Felicidades campeón, que tú eres de los que se lo curra y mucho.


Un saludo


martes, 18 de noviembre de 2008

"I Dedicate" World Community Grid Members

Hoy desde la página web de WCG, encontramos un vídeo dedicado a todos los miembros que colaboran en dicho proyecto.
Os dejo el texto que aparece en su web.

'I Dedicate' – World Community Grid Members Video Montage

In October 2008, we asked members to send in their personal video dedications. There were many great submissions, and while we couldn't include all of them (even though we wanted to), we hope that you will enjoy this mash-up that we've put together.And tell everyone about the new video! We share the same passion about making the world a better place, so let's show more folks how simple it is to make a real difference

Pincha aquí para ver el video.

Hay que reconocer que se está convirtiendo en uno de los mejores proyectos por méritos propios.

Un saludo

Usuario del día en PrimeGrid

Otra vez volvemos a estar de enhorabuena, hoy el usuario del día en PrimeGrid es yattote.

Os dejo aquí el enlace de las posiciones de los miembros del equipo como usuarios del día, sigue karrash en primera posición, werwolf segundo y el propio yattote se consolida como tercero.

Un saludo

lunes, 17 de noviembre de 2008

¿Computación distribuida?, ¿BOINC? (2)

"Ahora que me han desbloqueado el Blog, vuelvo a editar éste artículo publicado el martes 12 de noviembre, para que las personas nuevas tengan una ligera noción de este mundo".


Como muchas de las personas que os asomáis por este blog, no sabéis qué es la Computación Distribuida ni el Boinc, os dejo este pequeño artículo para que tengáis una ligera idea de que estamos hablando.
Computación Distribuida (o Grid Computing en inglés)

Es un nuevo modelo de computación basado en el uso de una red de ordenadores independientes para el procesado de unidades de datos a través de un protocolo común, cuyo objetivo es crear una potente red de procesado de datos que puede incluso superar a los grandes supercomputadores.
Estas redes de computación distribuida son mayoritariamente utilizadas para investigaciones científicas que necesitan largos tiempos de procesado mediante ordenadores.
Existe gran variedad de proyectos científicos que utilizan estas redes para procesar las ingentes cantidades de datos que poseen.
Con ello son capaces de avanzar en sus investigaciones de manera muy eficiente gracias a la enorme potencia de cálculo de dichas redes.

Me gustaría colaborar. ¿Qué tengo que hacer?

En palabras más sencillas, cuando nuestros ordenadores están encendidos, cuando navegamos, hablamos con nuestros amigos, trabajamos, etc., están básicamente no haciendo nada. Además muchos de nosotros tenemos ordenadores con procesadores modernos y potentes, con buena cantidad de memoria y que pasan mucho tiempo encendidos sin hacer nada.

La computación distribuida utiliza estos recursos no aprovechados del ordenador, cuando el ordenador no hace nada o poco, para estudios científicos, realizando trabajo sin que te des cuenta, y sin molestar, en segundo plano.
Existen multitud de proyectos donde participar, en primer lugar elige uno o varios donde te interese participar, ya sea por su carácter práctico o porque te guste el tema. En segundo lugar debes unirte a ese proyecto usando BOINC.

¿Qué es BOINC?



BOINC = Berkeley Open Infrastructure for Network Computing.
Es un software libre de la Universidad de Berkeley que sirve como base para trabajar en estos proyectos, bájalo, instálalo, y únete a un proyecto.

Ahora mismo cuenta con 320.485 voluntarios activos, 562.451 ordenadores y una capacidad de cálculo en las últimas 24 horas de 1.188 TeraFLOPS

¿Qué consecuencias tiene tener estos proyectos trabajando?

Este software trabaja en segundo plano, con prioridad baja, solo usa los recursos que tú no usas, si en algún momento el ordenador necesita toda su potencia, el proyecto no trabajará, estando tu equipo disponible a plena capacidad.
Por poner un ejemplo imaginemos que el ordenador esta sin hacer nada, sólo aprovechando los recursos y trabajando en estos proyectos. Si en ese momento ejecutamos cualquier programa, o grabamos un cd, o abrimos un procesador de texto, los proyectos en segundo plano se pararán, de manera que tenga la potencia necesaria para ejecutarse, sin que la presencia de los proyectos en segundo plano molesten en absoluto.

Bueno, espero haberos aclarado algo.
Dar las gracias a karlsson, ya que muchas de las cosas aquí comentadas, están basadas en su introducción de Computación Distribuida.
Dar las gracias a los voluntarios que colaboran con la Wikipedia, ya que cada día demuestra su valía.
En éste mismo blog, hay un apartado de guías, consultarlo que os puede ser muy útil.


Un saludo

1.000.000 de puntos en 3x+1


Pues aunque parezca mentira y en los últimos estertores del proyecto (como sabéis van a parar de mandar unidades un tiempo), he conseguido llegar al 1.000.000 de puntos en el proyecto 3x+1

Es la primera vez que un miembro del equipo de Noticias3D.com consigue alcanzar éste hito en un proyecto.
Aún me acuerdo cuando empezábamos el día que karrash entró en la lista de los 100 mejores a nivel nacional y hoy ya somos 7 los integrantes del equipo que están en esas posiciones de privilegio.
Un saludo

domingo, 16 de noviembre de 2008

Campeonato para Navidades en WCG

Yoyo, del equipo Rechenkraft.net, nos invita a participar en una competición en World Community Grid para estas navidades. Dicha competición empezará el día 1 de Diciembre y acabará el 24 del mismo mes, justo antes de la víspera del día de Navidad.

Ya son unos cuantos equipos quienes se han unido a esta competición, entre ellos equipos poderosos como SETI.Germany, L´Alliance Francophone o UK BOINC Team, por lo que el primer puesto no se lo llevaría en ningún caso el equipo de N3D, pero sí se le daría un empuje importante y recuperaría posiciones que se han perdido en los últimos meses.
También cabe mencionar que este proyecto no da tantos puntos como otros, por lo que el RAC se vería afectado durante el tiempo que dure este campeonato, aunque tampoco debemos olvidar la importancia de estos proyectos médicos y su finalidad.
¿Nos apuntamos? :D

viernes, 14 de noviembre de 2008

Las primeras imágenes de planetas extrasolares

Es la primera vez en la historia que los astrónomos han conseguido obtener imágenes ópticas de planetas orbitando alrededor de estrellas fuera del sistema solar.

Los astrónomos, han logrado captar la imagen de un grupo de planetas orbitando en torno a una estrella, la HR 8799, situada a 130 años luz de la tierra, con 1,5 veces la masa del sol y que los astrónomos califican como una auténtica mina de oro para conocer la formación de planetas extrasolares.

Los planetas visualizados son gigantes gaseosos, de masa y diámetro mayor que la de Júpiter, tienen unas órbitas tan alejadas que tardan cientos de años en completar un giro alrededor de la estrella. Con 60 millones de años de vida, aún brillan con la energía propia de su nacimiento.

Fuentes:
The Inquirer
Gemini
CanalBoinc

Un saludo

La hora del planeta

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